Det er derfor uklart, hvor Anne Marie to måneder efter brylluppet fødte sin søn Hans Christian. En mundtlig tradition fortæller, at fødestedet er Hans Jensens Stræde nr. 43-45. Her boede på fødselstidspunktet en kvindelig slægtning på fædrenes side, og indtil 1804 havde mormoderen boet der.
I kirkebogen for Sct. Hans sogn nævnes, at Hans Christian, søn af skomagersvend Hans Andersen og hans kone Anne Marie Andersdatter, blev født tirsdag den 2. april 1805 kl. 1 om morgenen, og at han er hjemmedøbt samme dag. I margenen er tilføjet, at fødestedet er Hans Jensens Stræde 43. Tilføjelsen er dog af senere dato.
Den 16. april samme år fremstilles H.C. Andersen i Sct. Hans Kirke.
Moderen havde i forvejen en datter, Karen Marie, født 1799 uden for ægteskab. Det er sandsynligt, at halvsøsteren har haft sin gang i barndomshjemmet og således har spillet en rolle i H.C. Andersens barndomsliv, men digteren nævner intet om hende i "Levnedsbogen" og "Mit livs Eventyr".
Andre kilder - blandt andet to breve til H.C. Andersen fra moderen, skrevet i 1822, samt digterens kalender-notater fra 8. februar 1842 - røber, at han længst muligt søgte at skjule dette familieforhold. Som voksen bosatte halvsøsteren sig i København, hvor hun levede sammen med en arbejdsmand ved navn Kaufmann. Måske var det søsterens lave sociale status kombineret med en letfærdig livsførelse, som bevirkede, at H.C. Andersen ikke ville vide af hende. I øvrigt boede også H.C. Andersens moster i København, hvor hun ernærede sig som bordelværtinde.